Deskripsi

Fokus kegiatan penelitian bioteknologi di FPIK UNPAD menitik beratkan pada jalur kekerabatan genetik suatu spesies ikan berdasar DNA mitokondria, jalur kloning hormon pertumbuhan ikan dan deteksi penyakit ikan atau udang yang disebabkan virus DNA atau RNA. Jalur-jalur ini dipilih karena disesuaikan dengan keahlian staf pengajar dan ketersediaan peralatan yang ada untuk fokus penelitian tersebut. Konsentrasi penelitian biologi molekuler menggunakan biota air (tawar ataupun laut) dengan tujuan akhir yang akan diperoleh adalah penemuan ikan unggul (pemuliaan ikan) untuk mendukung program budidaya yang dikembangkan pemerintah ataupun oleh masyarakat pembudidaya ikan. Tiga bidang penelitian yang mendominasi kegiatan penelitian di Lab. Bioteknologi tersebut yaitu seleksi ikan menggunakan keragaman dan kekerabatan genetik strain ikan dan polimorfisme diantara spesies dan genus yg berbeda; isolasi gen ikan, diantaranya isolasi gen penyandi hormon ikan isolasi gen penyandi enzim ikan dan bakteri dalam upaya mengidentifikasi hormon dan enzim yang sangat bermanfaat bagi jalur metabolisme hewan air dan deteksi penyakit virus (virus DNA atau virus RNA).

Sumberdaya Keahlian Bioteknologi FPIK Unpad
No Nama Staf Pengajar Bidang Ilmu Keahlian
1 Ir. Ibnu Dwi Buwono.,M.Si Bioteknologi Perikanan Isolasi DNA Hormon Pertumbuhan Ikan, Deteksi Virus dengan Nested-PCR, Kloning Gen, Bioinformatika; Transfer Gen
2 Dr.Ir. Ayi Yustiati.,M.Sc. Bioteknologi Perikanan Genetika ikan, Kekerabatan Genetik (RAPD-PCR), Isolasi DNA ikan
3 Yuniar Mulyani.,SP.,M.Si Bioteknologi Perikanan Kloning Gen, DNA Rekombinan, Kultur Sel ikan, Vaksin DNA
4 Eri Bachtiar,S.Si.,M.Si Bioteknologi Kelautan Ekstraksi senyawa bioaktif dengan MMR, identifikasi metabolit sekunder
6 Yeni Mulyani,S.Si,M.Si Bioteknologi Kelautan Bioproses senyawa aktif untuk bahan obat
7 M. Untung Kurnia A,Spi.,M.Si Bioteknologi Kelautan Ekstrasi bahan laut untuk senyawa aktif bahan obat, Kloning gen, Bioinformatika, DNA Rekombinan; Perakitan konstruksi gen
8 Roffi Grandiosa,Spi.,M.Sc. Bioteknologi Perikanan Imunostimulan untuk anti penyakit ikan, isolasi DNA ikan
9 Santi Rukminta A, STP.,M.Si Bioteknologi Kelautan Kekerabatan genetik rumput laut (RAPD-PCR), isolasi RNA dan DNA

 

Analis Laboratorium Bioteknologi

Tenaga analis sebagai pendukung sumberdaya manusia yang sudah dilatih untuk operasi peralatan dan bahan dalam pengerjaan isolasi-amplifikasi-elektroforesis sampel DNA ikan yaitu ibu Elis Sundari, S.sos yang memiliki pengalaman sesuai keahlian yang dibutuhkan dalam kegiatan laboratorium .

Peralatan Penelitian Pendukung Lab. Bioteknologi

Peralatan pendukung yang dimiliki semenjak tahun 2008 sampai sekarang, Lab. Bioteknologi disajikan dalam Tabel di bawah.
Peralatan pendukung penelitian di Lab. Bioteknologi Perikanan dan Kelautan

No Nama Barang Fungsi Barang Kondisi dan jumlah
      Baik Jumlah
1 Shaking waterbath Inkubasi sampel DNA baik 1
2 Microwave oven Pemanasan sampel atau bahan baik 2
3 Incubator Shellab Inkubasi pertumbuhan koloni sel Baik 1
4 Shaker incubator Inkubasi biakan mikroba dan kultur cair Baik 2
5 Autoclave mini Sterilisasi alat dan bahan Baik 2
6 Mesin PCR (thermal cycler) Amplifikasi fragmen DNA Tidak Fungsi 1
7 Microcentrifuge eppendorf Sentrifugasi larutan Baik 1
8 Vortex-mixer Homogenisasi larutan Baik 1
9 Hot plate magnetic stirrer Pemanasan larutan Baik 2
10 Micropipet 10 ul; 100 ul dan 1000 ul Pengambilan larutan Baik 2
11 Spektrofotometer Genesys 10 Pengukuran konsentrasi DNA Baik 1
12 1 set Unit elektroforesis Elektroforesis DNA / RNA Baik 1
13 Timbangan analitik Penimbangan bahan (ug) Baik 2
14 Timbangan Digital Penimbangan bahan (ug) Baik 1
15 pH meter Pengukuran pH larutan Baik 1
16 Deep Freezer -200C Penyimpanan DNA Baik 2
17 Lemari es Penyimpanan bahan Baik 3
18 Microcentrifuge refrigerated Sentrifugasi DNA/ RNA dingin Baik 1
19 Termometer Celcius Pengukuran suhu larutan Baik 15
20 Timbangan analitik digital Penimbangan mikro bahan Baik 1
21 Orbital shaker Inkubasi larutan / ekstrak Baik 1
22 Shaking incubator-oven Inkubasi sampel secara bergoyang Baik 1
23 Freezer -25 0C Penyimpanan sampel DNA Baik 2
24 Refrigerator Penyimpanan hasil biakan murni Baik 1
25 Micropippet bioRad Pengambilan larutan mikro Baik 2
26 Jangka sorong digital Pengukuran diameter koloni sel bakteri Baik 5
27 Rotary Evaporator Ekstraksi bahan aktif Baik 1
28 Laminar flow mini Pengerjaan kultur sel bakteri Baik 1
29 Pure water system Pemurnian akuades Baik 1
30 Incubator Co2 Inkubasi biakan sel bakteri Baik 1
31 UV transilluminator Visualisasi dan Dokumentasi fragmen DNA Baik 1
Topik Penelitian dan Pelatihan

Topik penelitian dosen dan mahasiswa yang dikerjakan di Lab. Bioteknologi Perikanan bervariasi, yang menggunakan objek penelitian antara ikan, udang, rumput laut, virus ikan atau udang serta enzim yang dihasilkan oleh bakteri dalam saluran usus ikan. Pada tabel di bawah disajikan kegiatan penelitian dosen dan mahasiswa di bidang bioteknologi perikanan dan kelautan.

Beberapa Contoh Kegiatan Penelitian berbasis Biologi Molekuler yang pernah dilakukan di Lab. Bioteknologi

  • Penelitian Insentif Riset Dasar Kemeneg Ristek tentang Isolasi dan Kloning Gen Hormon
    Pertumbuhan Ikan Mas Majalaya dan Nila Gift
  • Pelatihan PCR oleh suplier pada staf pengajar FPIK UNPAD
  • Uji coba peralatan dan bahan PCR-elektroforesis di eks Lab. Fisiologi Ikan
  • Penelitian tentang kekerabatan genetik ikan gurame dan deteksi virus WSSV pada udang
    windu dan vanamei dengan PCR
  • Pelatihan Isolasi dan amplifikasi DNA WSSV pada udang windu dan Vanamei dengan
    teknik PCR (program rutin setiap tahun yang diagendakan) untuk mahasiswa S1
  • Pelatihan Aplikasi Bioinformatika dan Disain Primer Untuk Penelitian Biologi Molekuler
    Perikanan (instruktur Balai Penelitian Ikan Hias Air Tawar Depok, Bogor)
  • Penelitian Hibah Bersaing Dikti tentang Perakitan DNA Rekombinan untuk anti virus KHV
    ikan mas
  • Penelitian DIPA UNPAD tentang keragaman genetik ikan di waduk Saguling dengan teknik
    PCR
  • Penelitian DIPA UNPAD Studi Ekobioteknologi Ikan Endemik di Waduk Saguling dengan
    RAPD-PCR
  • Penelitian DIPA UNPAD: Hasil Ekstraksi Senyawa Metabolit Sekunder Untuk Antibiotik dan
    Anti Bakteri Pencegahan Penyakit Ikan Air Tawar
  • Lanjutan Penelitian Hibah Bersaing Dikti tentang Perakitan DNA Rekombinan untuk anti
    virus KHV ikan mas
  • Penelitian DIPA Unpad:Sensitivitas Nested PCR Terhadap Deteksi KHV Ikan mas dan koi
  • Penelitian DIPA Unpad:Penggunaan Obat Herbal Alami Unt Penanggulangan Penyakit
    Aeromonas sp.
  • Pengajuan Hak Paten Sederhana : Deteksi Infeksi KHV Ringan Dengan Metode Thermal
    Lysis – Nested PCR
  • Penguasaan BIOINFORMATIKA (via Tugas Belajar : UNTUNG, S.Pi) Sekolah Pasca
    Sarjana Bioteknologi ITB
  • Pelatihan Single Nucleotide Polymorphism (SNP) With BeadXpress Reader from Illumina
    (PT. Pandu Biosains Jakarta)
  • Penelitian DIPA UNPAD: Ekstraksi Obat Herbal Alami Untuk Pencegahan Penyakit
    Streptococcus pada ikan
  • Penelitian tentang kekerabatan genetik ikan belut sawah di Jawa Barat dengan
    menggunakan Primer RAPD
  • Penelitian tentang kekerabatan genetik berdasar Sitokrom b pada ikan Sidat
  • Penelitian Hibah Bersaing: Kloning dan Ekspresi cDNA Hormon Pertumbuhan lele Dumbo
    dalam E. coli Dengan Strategi RACE
  • Pengkayaan Artemia dengan probiotik untuk Peningkatan SR Larva Patin (nutrigenomik)
  • Penelitian DIPA UNPAD tentang Ekstraksi senyawa Bioaktif mangrove yang berpotensi
    sebagai pengobatan untuk penyakit ikan
  • Penelitian Perakitan Konstruksi vektor Ekspresi Gen Hormon Pertumbuhan lele dumbo untuk
    produksi larva lele lokal transgenik
  • Penelitian Over ekspresi Gen pengkode enzim Desaturase untuk meningkatkan produksi omega 3
    pada ikan mas
  • Penelitian Isolasi dan kloning gen pengkode Agarase dari rumput laut

Pelatihan Soft Skill S1 di Lab. Bioteknologi :

  • Isolasi Gen Hormon Pertumbuhan Ikan Mas dg PCR
  • Isolasi DNA WSSV Udang Vanamei dan Windu dg PCR
  • Polimorfisme Ikan Mas dengan Teknik RAPD-PCR
  • Polimorfisme Ikan Patin dengan Teknik Microsatelite-PCR
Mata Kuliah Binaan

Berkaitan dengan keahlian biologi molekuler, mata kuliah pada program studi Perikanan yang diasuh oleh anggota Lab. Bioteknologi Perikanan dan Kelautan sebagai berikut :

  • Genetika Ikan (Prodi Perikanan)
  • Bioteknologi Perikanan (Prodi Perikanan)
  • Bioteknologi Kelautan (Prodi Kelautan)
  • Rekayasa Biologi Molekuler (Prodi kelautan)